Intrigue #1 :
Edward, maintenant 16 ans, et Alphonse, 14, Retourne à Rizenbul. Après un combat qui c'est avérée plus difficile que prévue, les méka-greffes de l'achimiste et le corps de son frère, ont été endomagé. En arrivant, ils apprennent que Winry à trouvée une jeune fille dans un champ. Cette dernière dit ne pas connaitre Rizenbul, ni tout autre lieu de Shambala. A-t-elle perdue la mémoire?
Pendant ce temps, à Central, c'est tout un remue-ménage! Roy Mustang, le Flame Alchemist, essayent de gravir les échelons pour devenir généralissime et des attaques inscessante sont envoyées par des Ishbals furieux. Le Lieutenant-colonnel Maes Hughes Fait tout en son pouvoir pour protèger le mieux possible les habitants.
Les Homonculus, quant à eux, se contentent de se cachés dans le camp Ishbal en essayant de contrôler ces derniers pour obtenir la pierre Philosophale et Ainsi devenir de véritable humains.